Sáng ngày 27/7/2016: tại phiên họp thứ nhất, Quốc hội khóa XIV đã bỏ phiếu kín bầu ông tiếp tục giữ chức vụ Viện trưởng Viện KSND nhiệm kì 2016-2021, với 448 phiếu thuận (tương đương 90,69%).[8]

Ngày 15/3/2017: trên cương vị Viện trưởng Viện KSND tối cao, ông đã yêu cầu Cơ quan Cảnh sát điều tra (Công an Tp.Vũng Tàu, tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu) ra ngay quyết định khởi tố bị can Nguyễn Khắc Thủy (sinh năm 1940, nguyên Giám đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam chi nhánh tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu) ngụ ở chung cư Lakeside, phường Nguyễn An Ninh, thành phố Vũng Tàu về tội “Dâm ô trẻ em”, theo quy định tại Điều 116, Bộ luật Hình sự dưới yêu cầu của Chủ tịch nước Trần Đại Quang.[9] Mặc dù trước đó hai ngày, ngày 13 /3/2017, Viện KSND Tp.Vũng Tàu đã không phê chuẩn quyết định khởi tố bị can mà gia hạn thêm 2 tháng để tiếp tục điều tra “vì nhận thấy chưa đủ cơ sở, cần phải củng cố thêm chứng cứ”.[10][11][12] Ngày 17/11/2017, TAND Tp.Vũng Tàu đã tuyên phạt Nguyễn Khắc Thủy (77 tuổi) 3 năm tù về tội Dâm ô đối với trẻ em trong phiên tòa sơ thẩm.[13][14]

Trong nhiệm kì này thư ký của ông là Mai Trung Thành - Phó Chánh văn phòng Viện KSND tối cao được bổ nhiệm làm Phó Viện trưởng Viện KSND TP.Hồ Chí Minh ngày 29/10/2019.[15]